复合乳酸菌胶囊临床上多用于肠道菌群失调引起的肠功能紊乱，如急、慢性腹泻，也可用于细菌性肠炎、败血症腹膜炎等导致的胃肠功能紊乱。复合乳酸菌胶囊服用时间，需根据病情及个体差异进行综合判断，而且其治疗效果会决定疗程时长。

复合乳酸菌胶囊是复合乳酸菌制剂，里面有三种成分的活乳酸菌，包括有乳酸乳杆菌、嗜酸乳杆菌和乳酸链球菌。这个药物可以帮助调整肠道菌群，能够防止细菌在肠内发酵，减少胀气、促进消化，还有止泻的作用。复合乳酸菌胶囊能够有效地调节肠道内的菌群，使肠道紊乱渐渐地恢复正常，能够有效地改善腹泻等症状。

根据患者具体病情不同及个体差异，疗程长短会不相同，主要根据服药之后病情变化。如病情明显缓解，症状消失，可随时停药。如病情反复发作，治疗之后效果不明显，尤其用药1周左右无明显效果，应调整用药或进一步检查明确有无其它原因导致腹泻。

建议患者在饭后半小时服用复合乳酸菌胶囊，可以减少对胃的刺激。铋剂、鞣酸、药用炭、酊剂等能抑制吸附活菌，不建议同时使用，以免降低该药疗效。抗酸药、抗菌药可减弱其疗效，应间隔3小时分开服用。孕妇及哺乳期妇女应在医生的指导下服用。