该类药物在正常情况下，一般都不会建议患者长期使用，但是奥美拉唑肠溶胶囊对于一些特殊的患者，可以在医生的观察下长期使用，特别是临床上的一些消化性溃疡疾病和胃食管反流疾病。如果患者反复出现消化系统症状，可维持较长时间。
其如果患者需要长期服用，需要注意是否会引起患者胃部的息肉恶化。而胃底息肉的恶性概率几乎不存在，不需要特殊治疗。如果在运用该类药物的同时，还需要长期口服一些抗血小板药物，会导致这些药物的抗血小板作用可能下降，此时尽量避免使用奥美拉唑胶囊。对于临床症状未消失，辅助检查仍有反流性食管炎证据的患者，每2~4周随访一次，直至临床症状消失，辅助检查无反流性食管炎。以后随访频率是三个月一次。
患者造成这种疾病，一般都是因为饮食的原因造成的，同时患者也需要通过正常的饮食，来保证自身的病情不会再一次复发。因此，患者在积极配合医生的同时，要注意饮食调节，奥美拉唑肠溶胶囊服用期间养成良好的饮食习惯，高蛋白、低脂肪、无刺激、易消化的饮食为宜，如菜粥、鸡蛋汤等。患者平时也要尽量克制自己，尽最大的努力去配合医生的治疗。
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