临床上蒙脱石散主要是用于急慢性的腹泻，治疗食道、胃、十二指肠疾病引起来的相关的疼痛。主要用于治疗腹泻，对于婴幼儿腹泻也有着良好的治疗的作用。蒙脱石散是一种胃黏膜保护剂，口服以后可以附着在肠黏膜部位，从而起到保护肠黏膜的作用。它可以覆盖消化道黏膜与粘液蛋白结合来增强黏液性屏障。可以促进损伤的消化道粘膜上皮再生，修复损伤的细胞间桥式细胞紧密连接。
蒙脱石散可以吸附消化道内气体和各种攻击因子并使之失去致病作用。可以平衡正常的菌群提高消化道的免疫功能，对消化道局部具有止血的作用。可以促进肠粘膜细胞的吸收功能减少其分泌。所以蒙脱石散主要用于保护消化道黏膜，能够覆盖保护消化道，加强消化道黏膜的防御功效，抵御致病因子的攻击，可以发挥正常的菌群，对人体的抗病能力有一定加强的作用。
蒙脱石散是非处方药，是比较安全的药物，对于老人、成人和儿童都可以使用，在用药时要将药物一定加入50ml的温开水，冲服之后再可以使用，千万不要直接倒入口中，容易引起呛咳。其副作用少数人可能会产生轻度的便秘，出现便秘可以通过减少剂量继续服用，若是治疗急性腹泻，一定要注意纠正脱水。若需要同时服用肠道的杀菌药时，需要与药间隔至少一个小时以上的时间，以免影响杀菌药的疗效。
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