熊去氧胆酸胶囊可能会出现的副作用是腹泻，胃痛，支气管炎，咳嗽，头晕，脱发，肌肉疼痛，过敏等，因此在服用药物过程当中，要密切关注自身状况，一旦出现过敏反应，及时停药，并且前往医院就诊。
熊去氧胆酸胶囊主要用于不合适手术治疗的胆固醇型胆结石，还可以预防胆结石的形成，也可以治疗胆囊炎，胆管炎等，另外患者如果出现肝肿大，胆汁反流性胃炎等也可以用这个药物治疗。特殊人群在使用此药时要听从医医嘱，比如孕期及哺乳期妇女，严重肝功能减退的患者，胆道完全阻塞的患者，对胆汁酸过敏的患者，未成年的患者都需要提前咨询医生确定是否可以使用，以及如何使用。选择此药进行溶石治疗的患者，一般需要服用6到24个月，在服用12个月之后，结石没有变小的患者停止服用;用于治疗胆汁反流性胃炎的患者，晚上睡前用温水送服，必须定期服用一次，一粒一天，一次服用10到14天后去医院复查，下一步如何使用，要遵医嘱。
上述属于肝胆科室的药物熊去氧胆酸胶囊会对胃肠道造成刺激，出现腹泻拉稀的情况较为常见。在治疗原发性胆汁性肝硬化的时候，剧烈的右上腹疼痛的情况较为罕见，基本没有。当治疗肝胆功能紊乱的时候，极少会出现胆结石钙化的情况。当出现荨麻疹则要停药去医院治疗，不排除出现过敏情况。
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