注射用培美曲塞二钠副作用主要是表现在以下几方面：胃肠道反应，比如患者可能会出现恶心、呕吐、食欲减退、上腹部疼痛等相关症状；影响血液系统，比如患者可能会出现粒细胞、白细胞、血小板的减少以及贫血，因此在使用药物时应该注意定期监测血常规；肝功能异常，比如患者可能会出现转氨酶升高；影响神经系统，比如可能会影响患者的感觉神经，也有可能导致患者出现味觉障碍；过敏反应，对于有些患者而言可能会出现皮疹等相关症状。

注射用培美曲塞二钠可以抑制体内叶酸的合成，从而导致人体内叶酸缺乏引起相关不良反应。此外培美曲塞常见的不良反应还有骨髓抑制，中性粒细胞减少以及血小板减少为最常见。胃肠道反应包括胃炎，恶心，呕吐，腹泻，肝功能损害，一过性转氨酶升高。部分患者也可以出现皮疹。在用药期间补充叶酸和维生素B12可以大大减轻骨髓抑制和胃肠道不良反应。

注射用培美曲塞二钠在使用的过程中副作用比较多，所以患者在用药期间需要遵照医嘱的建议，定期监测相关的指标，例如肝功能、血液的指标。如果出现任何不适症状，需要及时告知医生或者药师，应停止用药。