克林霉素磷酸酯凝胶有可能会出现副作用，但是由于每个人的体质状态是不同，使用药物剂量不同，所以出现副作用的几率也会存在一定的差异。只有极少数人群在使用之后，有可能会出现皮肤干燥或者是局部皮肤受到刺激，也可能会导致皮肤过敏，引起皮疹和瘙痒症状。偶尔还可能会出现肠胃道不适，造成恶心呕吐和腹部疼痛、腹泻等症状。

克林霉素磷酸酯凝胶主要具有抗菌效果，在皮肤吸收之后可以水解成克林霉素，从而达到杀灭细菌和抑制细菌活性的作用，尤其是对痤疮丙酸杆菌具有较好的抗菌活性，同时在使用之后还可以抑制皮肤表面的脂肪酸，也能使脂肪酸减少，有利于痤疮疾病治疗好恢复。该药物可用于治疗寻常痤疮，能够改善因痤疮所引起的皮肤红肿和疼痛的症状，同时在皮肤上面出现脓包和肿胀问题之后，也可以使用该药物来做调理。

克林霉素磷酸酯凝胶在使用之后如果出现了不良反应，应及时停止使用药物，大部分的人群在停止用药之后，副作用会逐渐的消失。对于12岁以下的儿童，必须要在医生的指导下才可以使用，孕妇要慎重用药，哺乳期间的妇女如果必须要使用药物，在使用期间是不可以哺乳的，需要等到停止用药之后才可以继续哺乳。