咪喹莫特每周使用3次，临睡前将本品均匀涂抹一薄层于疣体表面，轻轻按摩至本品完全吸收，用药部位不要封包并保留6～10小时，随后用中性肥皂和清水洗去用药部位的药物。用药时间一般在8～12周，最多不超过16周。治疗局部不可用敷料封包，用药期间避免包括生殖器官、肛门或口在内的性接触，包括使用避孕套的在内的剧烈的性生活，咪喹莫特乳膏可能会减低避孕套的功效。建议用药6～10小时后，用中性皂和清水佐以相关药物洗去。

激光治疗后，应该先用碘伏涂，咪喹莫特乳膏先不急用，等皮肤粘膜基本愈合后再用。如果发现有明显复发疣体，可以局部用，最好到医院复诊配合激光或光动力治疗。对于包皮过长，未行包皮环切术者，若疣体长在包皮内，应每天将包皮上翻后清洁;如出现严重不良反应，应及时就医;在医生指导下使用该药。避免接触眼睛、口、鼻等部位。　

咪喹莫特乳膏作为外用的治疗一般症状疣体的相关药物，涂抹来使用，要控制好时间和次数等，并要连续使用，保证效果好。同时如用药之后出现了局部轻度红肿的情况，可先不停用，而如果身体很不适的情况，则要停用了。