阿戈美拉汀片和百适可首先在药物成分上有所区别。阿戈美拉汀片的主要成分为阿戈美拉汀，百适可的主要成分为草酸艾司西酞普兰。

其次在功能主治上有所区别。阿戈美拉汀片是调节褪黑素受体和拮抗5-羟色胺，目前的基本功效是治疗抑郁发作、治疗抑郁症。同时阿戈美拉汀片由于作用于褪黑素受体系统，所以有可能对部分抑郁伴有失眠，或者伴有睡眠紊乱症状突出的患者，疗效会相对更好。 百适可是国产新型抗抑郁剂，也是选择性五羟色胺再摄取抑制剂，能够有效改善抑郁情绪，临床上主要用于治疗各种类型的抑郁症等。

第三在副作用上有所区别。阿戈美拉汀片的副作用主要表现在患者服用阿戈美拉汀片可能会出现头晕、头痛、嗜睡、失眠、焦虑等相关的症状。第二十胃肠道反应，可能表现为恶心、呕吐、上腹部不适、口干、腹泻等相关症状。肝功能异常，可能会出现转氨酶升高的现象。全身反应上，可能会出现疲劳、无力等不适的感觉。还可能会影响患者的骨骼、肌肉，患者服用阿戈美拉汀片可能会出现背痛等相关症状。

百适可的主要副作用表现为抗胆碱能不良反应，例如可引起患者口干、便秘、排尿困难、会加重前列腺肥大患者梗阻症状。还可引起心慌、心悸等心血管不良反应。对于双相障碍抑郁发作患者来说，单纯服用百适可有诱发躁狂发作的可能。对于男性患者来讲，长期服用百适可能会对性功能有不良影响。