临床研究发现，昆仙胶囊少数患者服药后会出现恶心，胃部不适，纳差，胀痛，腹痛，胃痛，便秘，皮疹，色素沉着，口干等症状，此时应给予相应的处理或遵医嘱处理。空心胶囊具有祛风除湿补肾通络的功效，有效的治疗患者出现的关节肿胀，关节疼痛屈伸不利关节，喜暖畏寒等病情，对于患有风湿性关节炎也可以起到调理的作用。

服用昆仙胶囊偶见个别患者出现肝功能轻度异常、白细胞减少。患者应减量服药或停药，并遵医嘱处理。昆仙胶囊可能引起少数女性患者出现月经紊乱(月经延迟、闭经)，男子精子减少。为观察昆仙胶囊可能出现的不良反应，服药过程中，定期随诊、检查、复查血、尿常规，心电图和肝肾功能。临床试验疗程为12周，目前没有超过临床试验疗程的安全性和有效性资料。

临床药效研究表明，昆仙胶囊具有免疫抑制、细胞因子拮抗和抗炎镇痛3大功效。在免疫抑制方面，昆仙胶囊对T细胞转化副作用，有显著的抑制作用，呈一定的剂量效应关系;对CD4、CD8细胞副作用均有一定抑制作用，也呈一定剂量效应关系。对CD4细胞的作用明显强于CD8细胞,可使风湿、类风湿性关节炎患者的CD/CD8副作用比值恢复正常，对正常机体的CD4/CD8比值无影响。对NK细胞的抑制效果较弱，对巨噬细胞的吞噬功能无明显影响。