长期服用更昔洛韦胶囊可能会造成患者体内粒细胞减少/中性白细胞减少及血小板减少。因此，长期服用更昔洛韦胶囊是有副作用的，罕见会出现头痛、头昏、呼吸困难、恶心、呕吐、腹痛、腹泻、厌食、消化道出血、心律失常、血压升高或血压降低、寒战、血尿、血尿素氨增加、脱发、瘙庠、荨麻疹、血糖降低、浮肿、周身不适、肌酐增加、嗜伊红胞增多等不良反应。有巨细胞病感染性视网膜炎的艾滋病患者可能出现视网膜剥离的风险。
更昔洛韦是一种常用的抗病毒药物，这种药物对于巨细胞病毒感染性疾病具有较好的抗病毒疗效，常用于治疗免疫力低下的人群合并巨细胞病毒的感染性疾病具有较好的治疗效果。常用于治疗巨细胞病毒所导致的视网膜炎，巨细胞病毒感染的中枢神经系统疾病。对于单纯性疱疹病毒感染性角膜炎也可以选择这种药物进行治疗，也可以取得理想的抗病毒疗效。
需要注意的是，如果对更昔洛韦过敏就禁用这种抗病毒药物。有的患者会出现不良反应，比如胃肠道反应、肝肾功能异常，可以表现为肌酐异常、转氨酶升高，如果出现较为严重的不良反应，也要禁用这种抗病毒药物。
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