血塞通滴丸和丹参滴丸都是可以扩张血管、可以溶解血栓的药物，功效上是有所不同的，在一定的情况下是可以同时用对相应病症起到协同治疗作用的。血塞通滴丸的功效是活血消瘀，通脉通筋，它可以扩张人体的血管，改善血液问题，增加血流量，还可以对血小板凝集起到抑制作用。而丹参滴丸的功效主要是活血化瘀以及理气、止痛。
功效不同使得它们的适应证也有所不同。血塞通滴丸主要用于心血管疾病，临床常用于血瘀导致的胸痹心痛病以及具有脑血管后遗症的患者。丹参滴丸主要用于治疗胸闷以及冠心病、心绞痛。在不良反应方面丹参滴丸比血塞通滴丸要少许多，血塞通滴丸可能会导致局部或全身皮疹，有报道称有患者使用血塞通滴丸后产生胸闷、心慌、哮喘，症状严重者甚至出现血尿、急性肾功能衰竭，过敏性休克，当然，一般情况下是不会有这些不良反应的。
根据临床经验，丹参滴丸相对安全一些，少数患者服用后会出现肠道不适，其他严重的不良反应尚未发现。同时，丹参滴丸的使用禁忌是尚不明确的，而血塞通滴丸就具有较多的使用禁忌。例如，在脑出血急性期或是有出血倾向的、正处于绞痛急性期的患者在说明书上是禁用此药的。
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