枯草杆菌二联活菌颗粒副作用有可能会导致轻微的恶心和呕吐的症状，也会伴有头晕，头痛和四肢乏力，有部分的人群还可能会出现心慌心悸，由于每个人的体质状态是不一样的，所以出现不良反应的概率也可能会存在差异，并不能完全一概而论。只要在医生的指导下，按照规定的剂量服用，出现不良反应的概率相对来说就会比较低。

枯草杆菌二联活菌颗粒里边含有很多的活性菌成分，这些活性菌成分能够达到调理肠道菌群的效果，有助于改善各种原因所引起的肠道功能紊乱的状态。在肠道发生紊乱之后，就有可能会引起大便次数增多或者是腹部疼痛的症状，同时还可能会引起胃胀气和肠胀气，通过口服该药物能够帮助临床症状得到有效的改善，也能改善食欲，使食欲能够增加。同时还可以帮助改善急性胃肠炎或者是胃肠功能紊乱之后所造成的腹泻症状，也能调理结肠炎和直肠炎所造成的腹泻。对于患者在出现大便干燥以及排便困难症状之后，也可以选择该药物调理。

枯草杆菌二联活菌颗粒在服用药物期间，如果出现了不良反应和副作用，要尽快停止使用药物，大部分人群在停药之后，不良反应就会逐渐消失。