婴儿健脾散和醒脾养儿颗粒这两种药物的主要区别是，婴儿健脾散是单纯的健脾消食止泻类药物，主要治疗脾虚引起的消化不良、不爱吃饭等，而醒脾养儿颗粒是除了有醒脾开胃的作用外还可以养血安神，对于婴儿脾气虚引起的烦燥、盗汗、遗尿、夜啼等症状有治疗效果。

当婴儿有消化不良的情况的时候就可以给婴儿吃婴儿健脾散或者是醒脾养儿颗粒。但是婴儿健脾散比醒脾养儿颗粒要好，因为婴儿健脾散适用于治疗婴儿消化不良的，同时还可以改善积食，而醒脾养儿颗粒主要是开胃醒脾的。需要引起注意的是婴儿消化不良的时候，不要喂食过多，要多吃纤维素含量比较高的食物，多吃新鲜的水果和蔬菜。婴儿健脾散主要含白扁豆、山药、白术、川贝母、木香、碳酸氢钠、人工牛黄。有健脾、消食、止泻的功效，用于消化不良、乳食不进、腹胀、大便次数增多。

醒脾养儿颗粒主要含一点红、毛大丁草、山栀茶、蜘蛛香。有醒脾开胃、养血安神、固肠止泻功效。用于脾气虚所致的儿童厌食、腹泻便溏、烦躁盗汗、遗尿夜啼。根据具体症状可以先吃其中一种，如果效果不好时可以换另外一种。醒脾养儿颗粒侧重于固肠止泻，用于脾气虚所致的腹泻。婴儿健脾散侧重于健脾，消食，止泻。用于消化不良导致的腹泻，因此，如果孩子腹泻选用婴儿健脾散更为好，因为孩子腹泻多见于消化不良。