服用藿香正气丸的副作用主要有偶尔会出现药疹、紫癜、休克等过敏反应，还可能出现肠梗阻、上消化道出血，对于小孩儿服用还可以出现低血糖的症状，所以这个药物一定要在医师的指导下才能进行服用，对于藿香正气丸合成粉有过敏的一定要禁忌服用

因此，服用藿香正气丸要注意以下问题：一、有高血压、心律失常、心脏病、肝病、肾病等严重慢性病者，孕妇或正在接受其它治疗的患者，应在医师的指导下服用藿香正气丸。二、患者服用藿香正气丸三天后症状无缓解或出现其他症状时，应停药并去医院就诊。

藿香正气丸具有解表化湿、理气和中的功效。用于外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿所致的感冒，症见头痛昏重、胸膈痞闷、脘腹胀痛、呕吐泄泻，胃肠型感冒见上述证候者。藿香正气丸主要由藿香、紫苏叶、白芷、厚朴、大腹皮、陈皮、半夏等药物组成，其中某些药物，可能对胃肠道具有一定的刺激作用。

为了减少对胃肠道的刺激，通常藿香正气丸在饭后服用较好，饭前服用可能会增加对胃肠道的刺激，由于患者本身可能伴有胃脘部不适的症状，饭前服用可能加重胃脘部不适，甚至出现严重的恶心、呕吐等症状。