氟康唑胶囊属于抗真菌药物，主要是用于治疗深部真菌感染，比如全身性念珠菌感染、隐球菌感染，特别是免疫功能低下或者用免疫抑制剂的人容易发生隐球菌的感染，另外就是黏膜的念珠菌感染，包括口腔、食道以及其他黏膜部位的真菌感染。
一般以下几种可以由氟康唑治疗：念珠菌病，用于口咽部、食道念珠菌感染、播散性念珠菌病等，及各部位、各类型的系统性念珠菌感染。隐球菌病，用于治疗脑膜炎以外的新型隐球菌相关病； 治疗隐球菌脑膜炎时，本品可作为两性霉素B联合氟胞嘧啶初治后的维持治疗药物。球孢子菌病，氟康唑胶囊属抗真菌药，口服吸收较好，且不受食物、抗酸药、H2受体阻滞剂药物的影响。
氟康唑胶囊最常见的副作用就是会有一定的消化道的反应，比如会引起恶心，呕吐或者是腹痛，腹泻，可能会有一些过敏反应，比如会表现为皮疹。另外还有一定的肝毒性的，在治疗过程中可能会出现轻度的氨基转移酶的升高，另外还可能会出现头晕头痛等症状。
患者按时服用氟康唑可有效地发挥氟康唑胶囊的抗真菌作用，比如可以治疗口咽部或者是食道的念珠菌的感染，还可以用于治疗隐球菌病，此外还可以用于接受化疗，放疗或者是免疫治疗患者的预防治疗。当患有真菌性感染的疾病时，可配合医生使用此药进行治疗。
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