九期一胶囊的副作用针对于患者心血管系统、免疫系统、消化系统等方面，使用药物的不良反应的程度均为轻度和中度。九期一胶囊目前没有用于其他类型的痴呆或记忆损伤的研究，对于其他类型的痴呆或记忆损伤，比如与年龄相关的认知功能减退的患者服用九期一胶囊应特别注意，最好是在医生的建议下再服药。

目前，九期一胶囊第三期临床试验随机的818例受试者中，共78例受试者在试验过程中发生了过性Ql/QTc间期延长。虽然尚未观察到心血管系统与九期一胶囊机制相关的明确的心血管风险，但由于目前使用本品的人数有限，患者服药时如果产生心血管系统异常的情况，请及时就医。

九期一胶囊可能具有一定的免疫调节作用，对于正在使用免疫制剂的患者，可能会影响免疫制剂的疗效。目前，在九期一第三期临床试验的受试者中，免疫炎症相关不良事件有出现自身免疫性脑干脑炎等情况，尽管经研究者判断与药物可能无关，但仍建议服用本品治疗的患者注意脑炎相关风险。

九期一胶囊可能对菌群发挥治疗作用，如果九期一胶囊与其他改变肠道菌群的药物，比如伽抗生素或其他可能导瞄道菌群失衡的药物)合用，可能会影响到九期一的疗效。

服用九期一的临床试验中，有患者出现头晕、嗜睡、师力的报告。因此，对于需要服用九期一胶囊的患者，医师应常规评估其驾驶汽车或操作复杂机器的能力。